16 вересня 2012 року Святіший Патріарх Московський і всієї Русі Кирил, який перебуває в Японії з Первосвятительським візитом, відвідав токійський цвинтар Янака, де перебувають чесні мощі святого рівноапостольного Миколая Японського. Біля гробниці святителя Миколая Предстоятель Руської Церкви звершив молебень просвітителю Японії.
Потім Святіший Патріарх відправив заупокійну літію за православними архієреями, похованими у цьому ж місці, — митрополитами Сергієм (Тихомировим, 1871-1945) і Феодосієм (Нагасімою, 1935-1999), а також за єпископом Миколаєм (Оно, 1872-1956). Заупокійні молитви були піднесені і про інших архіпастирів, які несли своє служіння в Японії протягом ХХ століття.
За богослужіннями молилися митрополит Токійський і всієї Японії Даниїл, керуючий справами Московської Патріархії митрополит Саранський і Мордовський Варсонофій, голова Відділу зовнішніх церковних зв'язків Московського Патріархату митрополит Волоколамський Іларіон, архієпископ Рівненський і Острозький Варфоломій, архієпископ Сендайський Серафим, керівник Адміністративного секретаріату Московської Патріархії єпископ Солнєчногорський Сергій, члени делегації, що супроводжує Предстоятеля Руської Православної Церкви, настоятель Подвір'я Руської Православної Церкви в Токіо протоієрей Миколай Кацюбан, клірики Японської Автономної Православної Церкви.
Служба комунікації ВЗЦЗ/Патріархія.ru