Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл утвердил предложенную председателем Синодального миссионерского отдела архиепископом Белгородским и Старооскольским Иоанном новую структуру отдела, включающую в себя секторы по различным направлениям миссионерской деятельности, а также коллегию, состоящую из руководителей секторов, приглашенных богословов, епархиальных миссионеров, ученых.

В настоящее время структура Миссионерского отдела представлена следующим образом:

• Миссионерский фонд и финансово-хозяйственная деятельность: руководитель — игумен Филипп (Симонов), заместитель председателя Миссионерского отдела, доктор экономических наук;
  
  
• Управление делами Миссионерского отдела: руководитель — Спирина Е.А., референт председателя отдела;
  
  
• Сектор «Координация работы с епархиальными миссионерами и миссионерскими станами»: руководитель — игумен Софроний (Китаев), благочинный храма святителя Иннокентия Московского Белгородской духовной семинарии;
  
  
• Сектор «Антисектантская работа и духовная безопасность»: руководитель — священник Андрей Хвыля-Олинтер, проректор по научной работе Белгородской семинарии;
  
  
• Сектор «Методология и практика миссионерской работы»: руководитель — протоиерей Димитрий Карпенко, секретарь Белгородского епархиального управления;
  
  
• Сектор «Подготовка миссионерских кадров»: руководитель — протоиерей Алексий Куренков, проректор по учебной работе Белгородской духовной семинарии;
  
  
• Сектор «Издательская деятельность и миссия в СМИ»: руководитель — священник Андрей Королев, руководитель Издательского отдела Белгородской епархии;
  
  
• Сектор «Миссионерское поле (аналитика)»: руководитель — Добренькова Е.В., первый проректор Международной академии бизнеса и управления, доктор социологических наук;
  
  
• Правовой сектор: руководитель — Лукин В.П., помощник управляющего Белгородской епархией по юридическим и внешнеэкономическим связям.

30 декабря 2009 г. в актовом зале Белгородской духовной семинарии под руководством архиепископа Белгородского Иоанна состоялось первое заседание коллегии отдела. Руководитель сектора «Антисектантская работа и духовная безопасность» священник Андрей Хвыля-Олинтер выступил с сообщением о состоявшейся миссионерской поездке в Биробиджанскую епархию. По результатам поездки была составлена аналитическая записка о религиозной ситуации в данном регионе, которая в ближайшее время будет размещена на портале «Миссия.ру».

По благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла на заседании коллегии были сформированы группы из числа священнослужителей и студентов Белгородской миссионерской семинарии для организации миссионерских станов в Абаканской, Анадырской, Магаданской, Улан-Удэнской, Южно-Сахалинской и Якутской епархиях. На лето 2010 года запланирована миссионерская экспедиция священнослужителей и воспитанников Белгородской семинарии в дальневосточные епархии Русской Православной Церкви. Игумену Агафангелу (Белых), руководителю миссионерского стана «Спасский» пос. Тикси Республики Саха-Якутия, поручена разработка маршрутов по побережью Северного Ледовитого океана и плана миссионерских мероприятий.

Миссия.ру/Патриархия.ru